蔡英文總統於 2016 年 8 月 16 日召開「對外經貿戰略會談」正式定調新南向政策綱領，以東協十國、南亞六國、紐西蘭與澳洲共十八國為目標合作夥伴國。新南向政策旨在增進臺灣和周邊鄰國的各項關係，透過科技、經貿及文化等各層面連結，共享資源、人才與市場，並創造互利共贏的新合作模式。
國家科學及技術委員會（以下簡稱國科會）透過持續深化新南向政策效益，積極開拓新南向潛在市場，全力爭取國際頂尖技術、研發和管理人才，以此呼應蔡英文總統於 2020 年就職演說中所提出的「穩定中追求成長、變局中把握先機」政策理念。
國科會主要任務為開拓、鏈結國際科研合作，聚焦前瞻生物醫學、半導體及資通訊科技（ICT）產業，及持續促進人文社會科學領域發展，邁向「創新、包容、永續」之願景。
推動策略
國科會新南向政策為補助國際科研發展、推動產學合作、鼓勵人才培育與交流等。2017 年配合中央政策研議推動「海外科學研究與技術創新中心」，目前已補助學研機構於 10 國設立 27 個海外科研中心（其中 18 個中心已補助期滿）；2018 年以「解決共同問題、創造共同利益、高階人才交流」為主軸，整合國內科研能量與區域共同關切議題，增進我國與東南亞及南亞國家實質關係。2019 年著重「以人為本」，以人才為核心，重視原創性基礎科學研究，強化跨國科研人才交流。2020 年則以「創新、包容、永續」為願景，強化推動創新產業與國際交流，藉由雙邊交流與長期駐點，瞭解夥伴國需求及相對優勢，進而穩固科研夥伴關係。至 2022 年底提出以「前瞻創新、民主包容、韌性永續」作為 2035 年的科技遠景，以前瞻創新思維盤點我國科技發展需求，回應聯合國 SDGs 擘劃韌性永續發展，並以民主包容觀點深入瞭解跨世代跨族群的需求。
長期願景與方向
國科會將以既有成果為基礎，積極推動「六大核心戰略產業」（尤其是「臺灣生醫核心戰略產業」、「資訊及數位相關產業」、「國防及戰略發展產業」及「綠電及再生能源產業」），國科會將著重於發展生醫創新、物聯網（IOT）及人工智慧（AI），整合國內產、官、學、研界能量，與新南向各國共同探討區域課題並創造共同利益。
定位與任務
「國科會補助新南向計畫專案辦公室」（以下簡稱本計畫辦公室）成立於 2016 年 10 月，本計畫辦公室初期任務為研析新南向夥伴國科技政策，協助國科會制定推動策略以及定義區域重要科研課題；後續為持續協助國科會追蹤新南向政策執行成效，調整任務方向為追蹤各項計畫執行進程、辦理研討會等交流會議、建構國內外科研平台等綜合型任務，主要任務如下：
1. 綜整暨推廣政策成果。
2. 追蹤新南向政策執行進度。
3. 研析新南向夥伴國科研資源。
4. 執行國科會新南向相關交辦任務。
5. 執行「海外科學研究與技術創新中心」行政業務。