科技部自然永續科學研究，包括三大主軸：
1. 新南向國家地球科學重點科技合作研究深耕計畫
重點及科技議題：
(1).地震與地殼結構研究
(2).地震災害研究與防治
(3).火山災害研究與防治
(4).山崩與洪氾災害研究與防治
(5).空間與遙測技術的推廣應用
2. 東沙科學研究站擴充及維運與南海國際科學研究設施建置與管理計畫
重點及科技議題：
於東沙和太平島成立研究站，提供國內和國際科學家現地研究的工作平台，吸引地球科學相關領域國際學者進駐，並投入南海區域相關科研。透過雙島基礎研究設施之建置，以及定期辦理科學研討會和各式研習會和加強南海周邊國家人才交流及培育之方式，擴大相關領域國際鏈結及跨領域研究合作，達成區域互惠互利共同發展之目標。
3. 建置維運新南向國家整合式災害情資決策系統與智慧防震技術輸出計畫
重點及科技議題：
以跨國防災科學研究為基礎，配合臺灣特有的防災經驗與管理知識，建立一個整體防災輸出的環境。透過建置監測系統、設計整合式災害情資決策系統與智慧防震技術輸出，實質輸出臺灣歷年在防災上之知識、經驗與產品，並配合科學研究與國際平台，發展與東協、南亞及紐澳等國家的關係，促進區域交流發展與合作。合作國：菲律賓、印尼、及越南等國。
圖-科技部智慧災防新南向執行推動辦公室組織架構
表-臺灣與新南向夥伴國於地球科學與災害防治方面合作概況
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合作國(依英文字首排列)
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進度
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印尼
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1.國立東華大學環境學院與印尼Universitas Diponegoro科數院簽署備忘錄
2.中央研究院地球科學研究所與印尼泗水理工學院簽署MOU
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馬來西亞
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與馬來西亞多媒體大學簽署MOU
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緬甸
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國立臺灣大學地質科學系與緬甸地質協會簽署MOU
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紐西蘭
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中華民國地質學會與臺灣地震科學中心與紐西蘭核科學有限公司意向書
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菲律賓
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國立中央大學與菲律賓大學簽署MOU
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泰國
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1. 科技部智慧災防新南向執行推動辦公室與國立臺灣大學生物環境系統工程學系與泰國朱拉隆功大學工程學院水資源工程系簽署三方MOU
2. 科技部智慧災防新南向執行推動辦公室與泰國朱拉隆功大學工程學院簽署MOU
3. 科技部智慧災防新南向執行推動辦公室與國立臺灣大學生物環境系統工程學系及泰國朱拉隆功大學工程學院簽署三方MOU
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越南
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1.國立東華大學與越南太原農林大學地理資訊系統研究中心簽署MOU
2.東部地震科學中心與越南太原農林大學地理資訊系統研究中心簽署MOU
3.科技部智慧災防新南向執行推動辦公室與越南太原農林大學地理資訊系統研究中心簽署MOU
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