聚焦自然科學議題，鼓勵國內學者以現有研究為基礎，妥適運用國際合作資源，與新南向夥伴國進行自然科學學術交流與合作，包括劇烈天氣、海洋氣象及短期氣候預報能力、大氣污染物整合監測、地震活動與地震潛能監測、隱沒帶地體構造探測調查、亞洲地體構造演化研究等，有助於自然災害準備與減災工作；同時發展廣域立體海洋大氣觀測網、海洋藍碳、西北太平洋生地化生態整體性研究、深海能源開發能量與工程技術建置、與國際建制接軌之國家海洋治理等，期拓展更多共同有興趣之實質合作關係，使臺灣成為西太平洋海洋科研的關鍵力量。
聚焦民生相關工程技術議題，藉由我國科技發展之經驗與技術能力，鼓勵學界以新南向夥伴國科技人才為合作對象，進行工程領域基礎研究、先導性應用研究以及具工程實務應用之研究甚或學術交流，同時改善民生相關工程研發環境，以及培育友我科技人才；目前與新南向夥伴國共同研究主題包含土木水利及環境工程，積極推廣我國工程及應用科技優勢，凝聚區域合作量能、經驗及默契，就共同課題找尋雙贏解法。
針對國內已有疫情之感染症，或具流行的威脅性，及尚未發生於臺灣但已出現於鄰近國家之人畜共通傳染病、流感、結核病、腸病毒、登革熱等新興感染症，與新南向國家進行臨床與基礎研究，建立夥伴關係及培養人才團隊。目前研究主題包含蚊媒傳染病、新興感染症、人類新興流感、登革熱、新興腸病毒及新型冠狀病毒疫苗與診斷系統研發等相關研究，繼而為發展雙方互利的產業發展奠基。
與新南向夥伴國共同研發具經濟價值農作物之非化學動、植物保護製劑前瞻技術和產品，配合抗逆境動植物的相關研究與智慧農業技術之研發領域研究，加強跨國農業人才及技術雙向交流，使臺灣農業研究成果與國際需要接軌。同時鼓勵本土生物多樣性研究保育與國際接軌，強化和新南向夥伴國的合作，並有效利用地理環境資源，將相關經驗與新南向夥伴國共享資源、共榮發展，使臺灣的生物多樣性研究更深更廣且更國際化。
1. 規劃研究共同華語與文化現象在臺灣及東南亞各國間在地化的傳播與詮釋，謀求在地知識，在全球華語的文化生產和語言交融概念裡，透過共榮與互惠，謀求文化扎根，促使臺灣高教與研究深耕。實際執行方式包含辦理跨國人文沙龍、線上講座及課程、出版、翻譯及學人短片製作等項目以促進學術交流。2.考量印度經濟、科技與文化影響力近年受國際社會矚目，為強化臺印在人文社會科學領域的學術合作，規劃組建臺印間人文社會學術鏈，鼓勵雙方研究人員展開合作交流，積極辦理相關活動及講座，凝聚研究能量。
以醫療衛生及農業科技相關議題為主軸，鼓勵國內學者以現有研究為基礎，擴充加值國際交流，妥適運用有限之國際合作資源，提升臺灣科研成就之能見度。